唐慎微出身世医之家，祖上都是行医之人，他在这样的环境里长大，耳濡目染，自小就对医学有着深厚的兴趣。虽然他其貌不扬，举止木讷敦厚，为人不善言辞，但内心却极为聪慧，心地善良纯厚。在家人的教诲下，他刻苦学习医学，由于他的聪颖勤奋，逐渐学会了医学的精髓，掌握了高超的医术，尤其是对经方深有研究。

青年时期的唐慎微，在学习之余，经常出去给病人看病，这使得他的医术造诣更得以飞速进展，由于他的医术高超，不久他就成为当地的名医。唐慎微对待病人一视同仁，凡是上门来求医问药者，无论是达官显贵还是平民百姓，在他眼里都是他的病人，从无高低贵贱之分。精湛的医术，加上高尚的医德，使他的声名远播各地。尽管如此，他仍然好学不倦。宋哲宗元祐年间（1086—1093年），他应曾经师承儒学大家程颐、程颢的蜀帅李端伯邀请，前往成都行医，暂时居住在成都府东南郊的华阳，后来迁居到了成都。

在成都行医期间，无论是在寒冷的冬季，酷热的夏天，刮风下雨，还是白天黑夜，他都是有招必往。他对待病人，认真辨症，仔细地望闻问切，经过他的精心治疗，病人都康复得很快，因此广受赞誉，人们都称赞唐慎微治病“百无一失”。他和其他医生不同的是，从不向病人索取诊金财物报酬，只求病人及其亲朋好友以其抄写的效方良药知识为酬。因此人们都愿意与他接近，把所知好方良药告诉他。即使从经史诸书中发现的医药知识，也必写、抄录下来告诉给他。

当时，成都华阳地方有位叫做宇文邦彦的名士患了严重的风毒病，请遍了成都的名医，名医们都束手无策，找不出方法来治愈他的病。这时，就有人推荐了唐慎微。经过唐慎微一诊察，没想到竟然手到病除。仅仅服药数剂就缓解了病情。在唐慎微的精心治疗下，宇文邦彦的病很快痊愈。可是，唐慎微断定这种病轻易是不断根的，如果身体稍弱这种病就会复发的，于是他就亲笔写了一封信，封好交给了宇文邦彦的儿子，并在信封上注明要等到某年某月某日才可以开封。到了这个日子，宇文邦彦的风毒之病果然再次发作。按唐慎微的嘱咐，宇文邦彦的儿子打开了封存已久的信件，只见上面写着三个方子：第一个方治疗风毒再作，第二个方治疗风毒攻注作疮疡，第三个方治风毒上攻、气促欲作咳嗽。结果按方治疗，半个月病就痊愈了。这件事传遍了成都，当时人们都叫他神医。