革兰氏染色与细胞壁结构的关系
革兰氏染色的结果同细胞壁的结构与组分有关。
现在一般认为，在染色过程中，细胞内形成了一种不溶性的结晶紫‐碘的复合物，这种复合物可被乙醇（或丙酮）从G－细菌细胞内抽提出来，但不能从G＋菌中抽提出来。这是由于G＋菌细胞壁较厚，肽聚糖含量高，交联程度高，脂质含量低甚至没有，经乙醇处理后引起脱水，结果肽聚糖孔径变小，渗透性降低，结晶紫‐碘复合物不能外流，于是保留初染的紫色。而革兰氏阴性细菌细胞壁肽聚糖层较薄，含量较少，交联程度低，而且脂质含量高，经乙醇处理后，脂质被溶解，渗透性增高，结果结晶紫‐碘复合物外渗，细胞经番红复染时呈现红色。