尼日利亚—刚果语系主要分布在非洲中部和非洲南部的部分地区。斯瓦希里语为此语系使用人数最多的语言，大部分使用者分布在坦桑尼亚东部和肯尼亚东南部。
该语系可分为5个亚语族：
大西洋亚语族，主要包括塞内加尔的沃洛夫语，几内亚、塞内加尔和马里的富拉尼语，马里、几内亚的曼丁戈语以及马里、尼日尔的桑海语；
沃尔特亚语族，主要语言是布基纳法索的莫西语；
几内亚亚语族，分布范围西起利比里亚东部到尼日利亚的几内亚湾一带，西部主要是阿肯语，东部主要是鲁巴语；
豪萨亚语族，主要分布区是尼日利亚北部及其附近地区，主要语言是豪萨语；
班图亚语族，包含的语种主要是尼日利亚东部的蒂夫语，喀麦隆和加蓬的芳语，刚果的刚果语、林加拉语、卢巴语，安哥拉的姆本杜语，莫桑比克的马库阿语，赞比亚的本巴语，坦桑尼亚和肯尼亚的斯瓦西里语，津巴布韦的绍纳语，南非的祖鲁语。