祁连山脉位于我国青海东北部和甘肃西部边境,是青藏高原的东北边缘。
因位于河西走廊南侧,又名南山。西端在当金山口与阿尔金山脉相接;东端至黄河谷地,与秦岭、六盘山相连。长近1000千米,大部分在青海省境内。
祁连山属于褶皱断块山,多雪峰和冰川。祁连山脉海拔一般在4000米以上,最高峰为疏勒南山的团结峰,海拔5827米。
祁连山的北侧与南侧分别以明显的断裂降至平原。狭义的祁连山仅指最北一列。它是黄河和内陆水系的分水岭。山间的谷地、河谷宽广,面积约占山地总面积的三分之一以上,是个水草丰美的牧场。地势较低的大通河谷、湟水谷地,更是青海省的重要农业区。
祁连山有着丰富的矿产资源,北祁连山有菱铁—镜铁矿、赤铁—磁铁矿;祁连山东段有黄铁矿型铜矿;肃北和酒泉南山一带有黑钨矿石英脉和钨钼矿,是中国西部钨矿蕴藏丰富的地区之一。祁连山还有不少珍贵动物,如马鹿、蓝马鸡、血雉等。